目前，在治疗前列腺炎的临床实践中，最常用的一线药物是抗生素，但是只有约5-10％的慢性前列腺炎患者有明确的细菌感染。

急性前列腺炎（I型）的抗生素治疗是必要而紧迫的。开始时可经静脉应用抗生素，如：广谱青霉素、三代头孢菌素、氨基糖甙类或氟喹诺酮等。待发热等症状改善后，改用口服药物（如氟喹诺酮），疗程至少4周。症状较轻者也应口服抗生素2~4周。

慢性细菌性前列腺炎（Ⅱ型）：根据细菌培养结果和药物穿透前列腺包膜的能力选择抗生素。药物穿透前列腺包膜的能力取决于其离子化程度、脂溶性、蛋白结合率、相对分子质量及分子结构等。常用的抗生素是氟喹诺酮类药物，如环丙沙星、左氧氟沙星和洛美沙星等。前列腺炎确诊后，抗生素治疗至少维持4~6周，其间应进行阶段性的疗效评价 。疗效不满意者，可改用其他敏感抗生素。

不推荐前列腺内注射抗生素的治疗方法。

慢性非细菌性前列腺炎（ⅢA型）：抗生素治疗大多为经验性治疗，理论基础是推测某些常规培养阴性的病原体导致了该型炎症的发生。因此推荐先口服氟喹诺酮等抗生素2~4周，然后根据疗效反馈决定是否继续抗生素治疗。只在临床症状确有减轻时，才建议继续应用抗生素。推荐的总疗程为4 ~6周。部分此型患者可能存在沙眼衣原体、溶脲脲原体或人型支原体等细胞内病原体感染，可以口服大环内酯类等抗生素治疗。

慢性盆痛综合征（ⅢB型）：不推荐使用抗生素治疗。